Le département de l’Ain possède plusieurs établissements relevant du champ de l’enseignement supérieur et de la recherche. Ils sont implantés à Bourg-en-Bresse et Bellignat.
Délocalisation de l’Université Jean Moulin Lyon III, le Centre d’Etudes Universitaires de Bourg-en-Bresse accueille, en formation initiale, 540 étudiants répartis dans six filières : quatre DEUG (Droit, Langues Etrangères Appliquées anglais-allemand et anglais-espagnol, Administration Economique et Sociale, Economie-Gestion), une licence (droit), une maîtrise de droit privé (mention droit des affaires). En formation continue, fonctionnent un DAEU (Diplôme d’Accès aux Etudes Universitaires) et une capacité en droit.
Toujours à Bourg-en-Bresse sur le site d’Alimentec, technopole des professionnels de l’alimentation, 700 étudiants sont scolarisés dans trois départements d’IUT (délocalisation de l’Université Claude Bernard Lyon I) génie biologique, génie thermique et énergie, informatique, un IUP (bio-technologie et bio-industrie) ainsi qu’à l’Ecole Supérieure de commerce et d’Industrie de l’Ain (établissement privé). Trois laboratoires de recherche travaillent sur le site.
La ville préfecture possède également un centre départemental de l’IUFM de Lyon qui forme 450 futurs enseignants.
Au c½ur de la « Plastics vallée », une école d’ingénieurs (Bac + 5) a vu le jour en 1992. Etablissement public sous tutelle du ministère de la jeunesse, de l’éducation nationale et de la recherche, l’Ecole Supérieure de Plasturgie, située à Bellignat, accueille 140 élèves-ingénieurs et possède un laboratoire de recherche pluridisciplinaire en plasturgie (LR2P) reconnu, en 1999, par le ministère. Cette reconnaissance lui permet d’accueillir et de former des étudiants de 3ème cycle, DEA et doctorants, en partenariat avec l'Université Claude Bernard (Lyon 1).
